Konfigurációs eszközök
A Yubikey két „réssel” (slot) rendelkezik, ahol az elsőt a Yubico a saját felhőjével konfigurálva szállítja. Éppen ezért a kulcsunkat nem kell oda felküldenünk, hiszen már ott van. A konfigurációs eszköz segítségével ezt természetesen felül tudjuk írni egy másik kulccsal, illetve másik módot is választhatunk, ahogy a kulcsunkat használnánk (pl. megadhatunk statikus jelszót, vagy használhatjuk OATH, Challenge response módban). Ha azonban ezen nem akarunk változtatni akkor használjuk a második slotot erre a célra. Az alkalmazás minden népszerű operációs rendszeren fut Windows, Linux, OS X.
A megfelelő telepítőt innen tudjuk letölteni.